Welche Projekte durch die LOTTO-Stiftung Berlin unterstützt werden, darüber entscheidet ein unabhängiger Stiftungsrat. Ihm gehören je drei vom Senat von Berlin bestellte und vom Berliner Abgeordnetenhaus gewählte Mitglieder an. Der Stiftungsrat wird für die Dauer der Wahlperiode des Abgeordnetenhauses gebildet und bleibt bis zur Neubildung im Amt. Er kommt in der Regel viermal im Jahr zusammen und berät über die Förderanträge, die bei der Stiftung eingereicht und durch die jeweils zuständige Senatsfachverwaltung begutachtet wurden.
Für die Dauer der 19. Wahlperiode des Abgeordnetenhauses von Berlin wurden folgende Stiftungsratsmitglieder bestellt:
Franziska Giffey - Vorsitzende
Regierende Bürgermeisterin von Berlin
Silke Gebel - stellvertretende Vorsitzende
MdA (Bündnis 90/Die Grünen)
Bettina Jarasch
Senatorin für Umwelt, Mobilität, Verbraucher- und Klimaschutz
Dr. Lena Kreck
Senatorin für Justiz, Vielfalt und Antidiskriminierung
Raed Saleh
MdA (SPD)
Kai Wegner
MdA (CDU)
Stand 09.09.2022